Ricettario di bioinformatica con Python

Recensioni dei lettori

Il libro è una risorsa completa per chi si occupa di biologia computazionale, con particolare attenzione alle applicazioni pratiche di Python in bioinformatica. Copre una varietà di argomenti, tra cui il sequenziamento di nuova generazione, la genetica delle popolazioni e la struttura delle proteine, offrendo esempi di codice e spiegazioni. Tuttavia, richiede una conoscenza medio-alta di Python e una certa familiarità con la terminologia bioinformatica.

⬤ Copertura completa di vari domini della biologia computazionale.
⬤ Fornisce consigli pratici sulla programmazione in Python ed esempi di codice.
⬤ Contenuti aggiornati e ben strutturati.
⬤ Presentazione chiara e concisa dei materiali.
⬤ Adatto a utenti di livello intermedio o avanzato nel campo della bioinformatica.

⬤ Richiede una conoscenza preliminare di Python e della terminologia bioinformatica.
⬤ Non adatto ai principianti di Python o della bioinformatica.
⬤ Il capitolo 1 sull'installazione del software può essere considerato superfluo da alcuni utenti con conoscenze pregresse.

(basato su 6 recensioni dei lettori)

Titolo originale:

Bioinformatics with Python Cookbook

Contenuto del libro:

Imparare a usare le moderne librerie e applicazioni bioinformatiche Python per fare ricerca all'avanguardia nella biologia computazionale

Informazioni su questo libro

Scoprite e imparate le librerie e le applicazioni Python più importanti per svolgere analisi bioinformatiche complesse Si concentra sugli strumenti più moderni per fare ricerca con il sequenziamento di nuova generazione, la genomica, la genetica delle popolazioni, la filogenomica e la proteomica Utilizza esempi reali e vi insegna a implementare metodi di ricerca di grande impatto

Per chi è questo libro

Se avete una conoscenza di livello intermedio di Python e conoscete bene le principali ricerche e il vocabolario dell'argomento bioinformatico di vostro interesse, questo libro vi aiuterà a sviluppare ulteriormente le vostre conoscenze.

Cosa imparerete

Acquisire una conoscenza approfondita delle librerie bioinformatiche fondamentali di Python ed essere esposti ai più importanti strumenti di scienza dei dati in Python Elaborare dati a livello di genoma con Biopython Analizzare ed eseguire il controllo di qualità su set di dati di sequenziamento di nuova generazione utilizzando librerie come PyVCF o PySAM Utilizzare DendroPy e Biopython per l'analisi filogenetica Eseguire analisi di genetica delle popolazioni su grandi set di dati Simulare demografie complesse e caratteristiche genomiche con simuPOP

In dettaglio

Se siete biologi computazionali o programmatori Python, probabilmente vi riconoscerete nell'espressione “crescita esplosiva, tempi entusiasmanti”. Python è probabilmente il principale linguaggio di programmazione per i big data e la marea di dati in biologia, soprattutto quelli provenienti dalla genomica e dalla proteomica, rende la bioinformatica uno dei campi più interessanti della scienza dei dati.

Utilizzando le ricette pratiche contenute in questo libro, sarete in grado di effettuare ricerche e analisi pratiche in biologia computazionale con Python. Vengono trattate le moderne librerie di sequenziamento di nuova generazione ed esplorati esempi reali su come gestire dati reali. L'obiettivo principale del libro è l'applicazione pratica della bioinformatica, ma vengono trattate anche le moderne tecniche di programmazione e i framework per gestire la crescente mole di dati bioinformatici.