Statistica e analisi dei dati per i microarray con R e Bioconductor

Recensioni dei lettori

Il libro è una guida completa sull'analisi dei microarray, sulla programmazione R e sulle tecniche statistiche applicabili alla genomica. È ben scritto, con spiegazioni chiare e uno stile didattico coinvolgente, che rende accessibili argomenti complessi a lettori di diversa provenienza. Pur essendo una risorsa eccellente sia per i principianti che per i professionisti esperti, alcune recensioni indicano una mancanza di profondità in alcune aree, in particolare per quanto riguarda Bioconductor e l'analisi RNA-seq.

Il libro è completo, ricco di contenuti e molto leggibile. È un ottimo riferimento sia per i principianti che per i lettori esperti, in quanto copre argomenti essenziali di biologia, statistica e programmazione R. L'autore è noto per le sue capacità didattiche. L'autore è noto per le sue capacità didattiche e per l'uso dell'umorismo, oltre che per l'inclusione di illustrazioni a colori che aiutano a comprendere concetti complessi. Molti lettori apprezzano le spiegazioni dettagliate e le intuizioni pratiche dell'autore, che ne fanno una risorsa preziosa per la bioinformatica.

Alcuni lettori hanno trovato il libro a volte difficile da seguire, in particolare a causa dei lunghi capitoli sulla statistica di base e sulla programmazione R. Sono state espresse critiche sull'insufficienza di informazioni su Bioconductor e sull'analisi dei dati microarray, inducendo alcuni a ritenere necessaria una conoscenza di base. Inoltre, diverse recensioni hanno menzionato la ridondanza delle spiegazioni sulle statistiche di base e la percezione di una mancanza di profondità nell'analisi dell'RNA-seq.

(basato su 18 recensioni dei lettori)

Titolo originale:

Statistics and Data Analysis for Microarrays Using R and Bioconductor

Contenuto del libro:

Riccamente illustrato a colori, Statistics and Data Analysis for Microarrays Using R and Bioconductor, Second Edition fornisce una descrizione chiara e rigorosa di potenti tecniche di analisi e algoritmi per l'estrazione e l'interpretazione delle informazioni biologiche. Tralasciando dettagli noiosi, formalismi pesanti e notazioni criptiche, il testo adotta un approccio pratico e basato su esempi che insegnano agli studenti le basi di R e della tecnologia dei microarray, nonché come scegliere e applicare lo strumento di analisi dei dati adeguato a problemi specifici.

Novità della seconda edizione.

Questa seconda edizione, completamente aggiornata e raddoppiata rispetto al suo predecessore, sostituisce il software commerciale con gli ambienti open source R e Bioconductor. Quattordici nuovi capitoli trattano argomenti quali i meccanismi di base della cellula, i problemi di affidabilità e riproducibilità dei microarray di DNA, la statistica di base e i modelli lineari in R, la progettazione degli esperimenti, i confronti multipli, il controllo di qualità, la pre-elaborazione e la normalizzazione dei dati, l'analisi della Gene Ontology, l'analisi dei pathway e le tecniche di apprendimento automatico. I metodi sono illustrati con esempi giocattolo e dati reali e il codice R per tutte le routine è disponibile su un CD-ROM allegato.

Con tutti i prerequisiti necessari, questo best-seller guida gli studenti dalle nozioni di base alle tecniche di analisi avanzate in R e Bioconductor. La prima metà del testo presenta una panoramica dei microarray e degli elementi statistici che costituiscono gli elementi costitutivi di qualsiasi analisi dei dati. La seconda metà introduce le tecniche più comunemente utilizzate nell'analisi dei dati di microarray.