Sistemi analitici e integrazione di grandi dati omici

Titolo originale:

Systems Analytics and Integration of Big Omics Data

Contenuto del libro:

Il "genotipo" è essenzialmente l'insieme delle informazioni ereditarie di un organismo, ottenute dai suoi genitori. Il "fenotipo" è l'insieme delle proprietà fisiche e comportamentali osservate di un organismo.

Queste possono includere tratti come la morfologia, le dimensioni, l'altezza, il colore degli occhi, il metabolismo, ecc. Una delle sfide più urgenti della biologia computazionale e dei sistemi è la previsione del rapporto genotipo-fenotipo. Si tratta di una sfida, data la quantità di dati generati dalle moderne tecnologie Omics.

Questi "Big Data" sono così grandi e complessi che le applicazioni tradizionali di elaborazione dei dati non sono all'altezza del compito. Le sfide sorgono nella raccolta, analisi, estrazione, condivisione, trasferimento, visualizzazione, archiviazione e integrazione di questi dati.

In questo numero speciale ci si concentra sull'analisi a livello di sistema dei dati Omics, sui recenti sviluppi nell'annotazione dell'ontologia genetica e sui progressi nella biologia dei percorsi biologici e delle reti. Viene esplorata l'integrazione dei dati Omics con i dati clinici e biomedici utilizzando l'apprendimento automatico.

Questo numero speciale tratta le nuove metodologie nel contesto delle interazioni tra geni e ambiente, dell'espressione genica specifica dei tessuti e dell'impatto dei fattori esterni o della genetica dell'ospite sul microbioma.