La risposta integrata allo stress: Metodi e protocolli

Titolo originale:

The Integrated Stress Response: Methods and Protocols

Contenuto del libro:

Parte I: Analisi della regolazione della traduzione dell'mRNA.

1. Una panoramica dei metodi per rilevare la fosforilazione di eIF2α e la risposta integrata allo stress.

Agnieszka Krzyzosiak, Aleksandra Pitera e Anne Bertolotti.

2. Screening basato su CRISPR per i fattori di risposta allo stress in cellule di mammifero

Xiaoyan Guo e Martin Kampmann.

3. Analisi multipla delle funzioni regolatorie delle uORF umane durante l'ISR mediante PoLib-Seq.

Gemma E. May e C. Joel McManus.

4. Misurazione dell'attività di traduzione di massa in singole cellule di mammifero durante la risposta integrata allo stress.

Alyssa M. English e Stephanie L. Moon.

5. Proteomica quantitativa della traduzione con mePROD.

Kevin Klann e Christian Mnch.

6. Quantificazione del legame dei nucleotidi di guanina marcati in modo fluorescente e del tRNA iniziatore al fattore 2 di iniziazione della traduzione eucariotica.

Martin D. Jennings e Graham D. Pavitt.

7. Sistemi di traduzione in vitro di mammiferi

Yulia Gonskikh, Valentina Pecoraro e Norbert Polacek.

8. Misurazione della traduzione non-AUG (RAN) associata alla ripetizione.

Shaopeng Wang e Shuying Sun.

9. Analisi dei dati di profilazione dei ribosomi.

Carine Legrand, Khanh Dao Duc e Francesca Tuorto.

10. Analisi del controllo traslazionale nella risposta integrata allo stress mediante profilazione dei polisomi.

Michael J. Holmes, Jagannath Misra e Ronald C. Wek.

11. Profilazione dei ribosomi ad alta risoluzione per determinare gli stati funzionali dei ribosomi durante l'allungamento della traduzione.

Mohammad Shafieinouri, Britnie Santiago Membreno e Colin Chih-Chien Wu.

12. Test dell'attività del fattore di scambio di nucleotidi di guanina di eIF2B basato sull'intensità della fluorescenza.

Yusuke Sekine, David Ron e Alisa F. Zyryanova.

Parte II: Analisi delle reti di interazione e dei granuli RNP.

13. Apprendimenti collettivi degli studi sull'assemblaggio e la composizione dei granuli di stress

Hadjara Sidib e Christine Vande Velde.

14. Rilevamento dei granuli di stress neineuroni di Drosophila

Fabienne De Graeve, Nadia Formicola, Kavya Vinayan Pushpalatha, Akira Nakamura, Eric Debreuve, Xavier Descombes e Florence Besse.

15. Monitoraggio e quantificazione della dinamica dei componenti dei granuli di stress nelle cellule viventi mediante il decadimento della fluorescenza dopo la fotoattivazione.

Anna-Carina Shnel, Nataliya I. Trushina e Roland Brandt.

16. Sondare i modelli di solubilità delle proteine con la proteomica per comprendere la dinamica delle reti.

Xiaojing Sui,.