Informatica del sequenziamento del DNA di nuova generazione, seconda edizione

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Titolo originale:

Next-Generation DNA Sequencing Informatics, Second Edition

Contenuto del libro:

La tecnologia di sequenziamento del DNA di nuova generazione (NGS) ha rivoluzionato la ricerca biomedica, rendendo il sequenziamento del genoma e dell'RNA uno strumento accessibile e frequentemente utilizzato per un'ampia varietà di applicazioni di ricerca, tra cui la scoperta di varianti (mutazioni), l'espressione genica, l'analisi dei fattori di trascrizione, la metagenomica e l'epigenetica. I metodi bioinformatici a supporto del sequenziamento del DNA sono diventati e rimangono un ostacolo critico per molti ricercatori e organizzazioni che desiderano utilizzare la tecnologia NGS. Questa nuova edizione offre un'introduzione completa e semplice ai metodi e agli strumenti informatici necessari per l'analisi dei dati NGS e fornisce descrizioni dettagliate degli algoritmi, dei punti di forza e di debolezza di strumenti specifici, delle insidie e dei metodi alternativi. Quattro nuovi capitoli trattano la progettazione sperimentale, la preparazione dei campioni e la valutazione della qualità dei dati NGS.

Banche dati pubbliche per i dati di sequenziamento del DNA.

Assemblaggio de novo dei trascritti.

Proteogenomica.

E le tecnologie di sequenziamento emergenti. I restanti capitoli della prima edizione sono stati aggiornati con le informazioni più recenti. Il libro fornisce inoltre ampi riferimenti ai metodi bioinformatici più efficaci per le applicazioni NGS e tutorial per i flussi di lavoro più comuni. Questa edizione risponde alle esigenze informatiche di studenti, scienziati di laboratorio e specialisti di informatica che desiderano sfruttare l'esplosione delle opportunità di ricerca offerte dalle nuove tecnologie di sequenziamento del DNA.

Autori

Alexander Alekseyenko.

Silvia Argim3n.

Brian D. Athey.

Miroslav Blumenberg.

Stuart M. Brown.

Lisa Cohen.

Efstratios Efstathiadis.

David Feny.

Jeremy Goecks.

Gerald A. Higgins.

D. Frank Hsu.

Kranti Konganti.

Konstantinos Krampis.

Guillermo I. Perez-Perez.

Kelly V. Ruggles.

Christina Schweikert.

Steven Shen.

Phillip Ross Smith.

Zuojian Tang.

Jinhua Wang.