Impronte in vivo: Volume 21

Titolo originale:

In Vivo Footprinting: Volume 21

Contenuto del libro:

La rivoluzione nella ricerca biologica iniziata con la dimostrazione che particolari molecole di DNA potevano essere isolate, ricombinate in modi nuovi e convenientemente replicate ad alto numero di copie in vivo per ulteriori studi, cioè l'era del DNA ricombinante, ha generato molti altri progressi, sia metodologici che intellettuali, che hanno migliorato la nostra comprensione dei processi cellulari in misura sorprendente. Nell'ambito del conseguente flusso di informazioni, la ricerca che esplora i meccanismi di regolazione genica, sia nei procarioti che negli eucarioti (ma soprattutto in questi ultimi), è stata particolarmente ben rappresentata.

Sebbene non si possa dire che un solo approccio tecnico abbia portato la ricerca al suo attuale livello di sofisticazione, la capacità di mappare le interazioni dei fattori trans-agenti con le loro sequenze di riconoscimento del DNA ad un alto livello di precisione è stata certamente uno dei progressi più importanti. Questo approccio di "footprinting" è diventato quasi onnipresente negli studi di regolazione genica. Tuttavia, è nella sua applicazione "in vivo" che le ambiguità, le confusioni e le incongruenze che possono sorgere da un approccio puramente "in vitro" possono spesso essere risolte e collocate nella loro giusta prospettiva.

In parole più semplici, il fatto che si possa dimostrare l'esistenza di un'interazione tra fattori purificati e un particolare pezzo di DNA in una provetta non dice ovviamente nulla sul fatto che tali interazioni si verifichino in vivo. La capacità di sondare tali interazioni mentre si verificano all'interno delle cellule, con la dovuta attenzione allo stadio di sviluppo o alla specificità tissutale dell'interazione in esame, ha reso l'approccio del footprinting in vivo un'aggiunta inestimabile all'arsenale di armi del "gene jockey".