Identificazione in silico dei microrganismi e delle loro cellule nella lenticchia

Titolo originale:

Identification in silico des micrornas et de leurs cibles chez la lentille

Contenuto del libro:

In questo lavoro, è stato adottato un approccio in silico per l'identificazione e la caratterizzazione dei miRNA conservati nei tag di sequenza espressa (EST) della lenticchia. Per l'identificazione di nuovi miRNA nella lente, le sequenze EST sono state ricercate per omologia con miRNA maturi noti del regno vegetale Viridiplantae utilizzando BLASTN online.

L'identificazione computazionale basata sulla genomica comparativa ha prodotto 12 potenziali candidati miRNA appartenenti a 12 diverse famiglie di miRNA nella lente. Infine, utilizzando i potenziali miRNA nel cristallino, sono stati previsti 25 geni bersaglio e sono state illustrate le loro probabili funzioni.

La maggior parte dei geni bersaglio dei miRNA del cristallino sembra codificare per la crescita, lo sviluppo, il metabolismo e la risposta allo stress, la resistenza alle malattie e così via. In un prossimo futuro, una migliore comprensione dei meccanismi molecolari dei miRNA nella pianta di lenticchia potrebbe contribuire allo sviluppo di una tecnica nuova e precisa per comprendere alcuni meccanismi di silenziamento genico post-trascrizionale in risposta alla tolleranza allo stress.