Genomica nel cloud di Aws: Analizzare il codice genetico con i servizi web di Amazon

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Titolo originale:

Genomics in the Aws Cloud: Analyzing Genetic Code Using Amazon Web Services

Contenuto del libro:

Eseguire l'analisi del genoma e il sequenziamento dei dati con Amazon Web Services.

Genomica nel cloud AWS: Analyzing Genetic Code Using Amazon Web Services consente a chi ha una moderata familiarità con AWS Cloud di eseguire analisi e ricerche complete sul genoma. Utilizzando le informazioni contenute in questo libro, sarete in grado di prendere un file FASTQ contenente dati grezzi da un laboratorio o un file BAM da un fornitore di servizi ed eseguire l'analisi del genoma su di esso. Sarete anche in grado di identificare sequenze di geni potenzialmente patogeni.

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Alcuni dei vantaggi principali dell'utilizzo di AWS per l'analisi genomica sono quelli di aiutare i ricercatori a utilizzare un'ampia scelta di servizi di calcolo in grado di elaborare diversi set di dati nelle pipeline di analisi. I sequenziatori genomici che generano file di dati grezzi si trovano nei laboratori in loco e AWS fornisce soluzioni per facilitare il trasferimento di questi file su AWS in modo affidabile e sicuro. L'archiviazione di dati genomici e medici (ad esempio, di imaging) in fasi diverse richiede un'enorme quantità di spazio di archiviazione in modo economicamente vantaggioso. Amazon Simple Storage Service (Amazon S3), Amazon Glacier e Amazon Elastics Block Store (Amazon EBS) forniscono le soluzioni necessarie per archiviare, gestire e scalare in modo sicuro l'archiviazione di file genomici. Inoltre, i servizi di archiviazione possono interfacciarsi con vari servizi di calcolo di AWS per elaborare questi file.

Sia che abbiate appena iniziato o che abbiate già analizzato i dati genomici utilizzando il cloud AWS, questo libro vi fornisce le informazioni necessarie per utilizzare i servizi e le funzionalità AWS nel modo più opportuno per la vostra ricerca genomica.