Titolo originale:
Essential Genes and Genomes: Methods and Protocols
Contenuto del libro:
1. Un metodo per mappare l'essenzialità genica delle cellule staminali pluripotenti umane mediante schermi CRISPR su scala genomica con Cas9 inducibile.
Barbara Mair, Michael Aregger, Amy H. Y. Tong, Katherine S. K. Chan e Jason Moffat.
2. Screening CRISPR/Cas9 per l'identificazione di geni condizionatamente essenziali in linee cellulari umane.
Kimberly S. Huggler, Nicholas J. Rossiter, Kyle M. Flickinger e Jason R. Cantor.
3.Identificazione del bersaglio di piccole molecole mediante la scansione su larga scala della mutagenesi CRISPR-Cas di geni essenziali.
Bert Kwanten, Jasper Neggers e Dirk Daelemans.
4. Progettazione e generazione di un sistema di interferenza CRISPR per la repressione genetica e l'analisi dei geni essenziali nel patogeno fungino Candida albicans.
Lauren Wensing e Rebecca S. Shapiro.
5. Identificazione di geni essenziali mediante schermi sequenziali di CRISPR e siRNA.
Luke DeHart, Oliver P. Yockey e Jesse Bakke.
6. Un metodo semplice che combina CRISPR e AID per generare rapidamente knockout condizionati per geni essenziali in varie linee cellulari di vertebrati.
Kohei Nishimura e Tatsuo Fukagawa.
7. Nuovo metodo per lo studio della genomica funzionale su scala genomica nei batteri con prestazioni superiori: Schermata di interferenza CRISPR
Xihao Liao, Xin-Hui Xing e Chong Zhang.
8. Un metodo basato su CRISPR per costruire mutazioni condizionali di geni essenziali nei cianobatteri.
Ju-Yuan Zhang, Tian-Cai Niu, Gui-Ming Lin e Cheng-Cai Zhang.
9. Un metodo di sequenziamento con inserzione di trasposoni per identificare in modo completo i geni di Vibrio vulnificus necessari per la crescita nel siero umano.
Miguel Carda-Diguez e Carmen Amaro.
10. L'uso di Tn-Seq e dell'analisi FiTnEss per definire il genoma essenziale di Pseudomonas aeruginosa.
Bradley E. Poulsen, Anne E. Clatworthy e Deborah T. Hung.
11. Analisi dei geni di virulenza di Escherichia coli K1 mediante sequenziamento diretto da trasposoni.
Alex J. McCarthy e Peter W. Taylor.
12. Utilizzo di librerie di mutanti su scala genomica per identificare geni essenziali.
Kevin S. Myers, Piyush Lal, Daniel R. Noguera e Timothy J. Donohue.
13. Identificazione e analisi di geni essenziali in Streptococcus mutans con il sequenziamento di trasposoni.
Alejandro R. Walker e Robert C. Shields.
14. L'uso di TnSeq per identificare geni essenziali di alfaproteobatteri rivela una variabilità operativa nei sistemi di sviluppo e ciclo cellulare conservati.
Gayatri Sharma e Patrick D. Curtis.
15. Un quadro proposto per identificare le funzioni dispensabili ed essenziali nei Bifidobatteri: Caso di studio di Bifidobacterium breve UCC2003 come prototipo del suo genere.
