Titolo originale:
Plant Phosphoproteomics: Methods and Protocols
Contenuto del libro:
1.Motivi dei siti di fosforilazione nelle protein chinasi vegetali e nei loro substrati.
Lin Xi, Zhaoxia Zhang, Sandra Herold, Sarah Kassem, Xu Na Wu e Waltraud X. Schulze.
2. Risposta della fosforilazione proteica allo stress abiotico nelle piante.
Rebecca Njeri Damaris e Pingfang Yang.
3. La fosforilazione delle proteine nella segnalazione delle cellule vegetali.
Ping Li e Junzhong Liu.
4. Profilazione fosfoproteomica di mutanti di chinasi recettoriali.
Dandan Lu, Ting Gao, Lin Xi, Leonard Krall e Xu Na Wu.
5. Analisi fosfoproteomica delle radici di soia in condizioni di salinità mediante l'approccio di etichettatura iTRAQ.
Yuchen Qian, Jia Xu e Erxu Pi.
6. Flusso di lavoro universale per la preparazione dei campioni per la profilazione fosfoproteomica delle piante
Chuan-Chih Hsu, Justine V. Arrington e W. Andy Tao.
7. Mappatura del fosfoproteoma vegetale con MOAC tandem migliorato e quantificazione senza etichetta.
Yanmei Chen e Xinlin Liang.
8. Proteomica quantitativa dei PTM basata su SILIA 4C
Emily Oi Ying Wong e Ning Li.
9. Analisi fosfoproteomica dei tessuti delle radici delle piante.
Zhe Zhu, Shubo Yang, Shalan Li, Xiaolin Yang e Leonard Krall.
10. Arricchimento di fosfopeptidi vegetali mediante cromatografia di affinità con ioni metallici immobilizzati.
Xiahe Huang, Yuanya Zhang, Haitao Ge, Dandan Lu e Yingchun Wang.
11. Fosfoproteomica vegetale basata sull'elettroforesi su gel bidimensionale e sulla colorazione delle fosfoproteine Pro-Q Diamond.
Yuan Li e Dongtao Ren.
12. DIGE bidimensionale combinata con colorazione Pro-Q Diamond per l'identificazione della fosforilazione delle proteine in Chlamydomonas reinhardtii: un approccio di successo.
Li Li.
13. Identificazione dei fosfopeptidi vegetali e quantificazione senza etichetta mediante MaxQuant e il software Proteome Discovery.
Shalan Li, Haitao Zan, Zhe Zhu, Dandan Lu e Leonard Krall.
14. Phosphat 4.0: un database aggiornato di Arabidopsis per la ricerca di siti di fosforilazione e interazioni chinasi-bersaglio.
Lin Xi, Zhaoxia Zhang e Waltraud X. Schulze.
15. Ricostruzione computazionale della rete di fosforilazione: An Update on Methods and Resources
Min Zhang e Guangyou Duan.
16. Applicazione di una piattaforma basata sul linguaggio R, cRacker, per l'analisi dei dati di fosfoproteomica.
Mingjie He e Zhi Li.
17.Saggio dell'attività chinasica mediante substrato non specifico o peptidi sintetici specifici.
Jiahui Wang, Xiaolin Yang, Lin Xi e Xu Na Wu.
