Cryoem: Metodi e protocolli

Titolo originale:

Cryoem: Methods and Protocols

Contenuto del libro:

Parte I - Criotomografia elettronica

1. Come iniziare con la tomografia crioelettronica in situ.

Daniel Serwas e Karen M. Davies.

2. Tomografia crioelettronica e segmentazione automatica di neuroni ippocampali in coltura.

Ryan K. Hylton, Victoria H. Seader e Matthew T. Swulius.

3. Approcci pratici per la fresatura crio-FIB e applicazioni per la tomografia crioelettronica cellulare.

Vinson Lam e Elizabeth Villa.

4. Imaging in situ e determinazione della struttura di complessi biomolecolari mediante tomografia crioelettronica.

Mohammed Kaplan, William J Nicolas, Wei Zhao, Stephen D Carter, Lauren Ann Metskas, Georges Chreifi, Debnath Ghosal e Grant J. Jensen.

Parte II - Analisi di singole particelle e criomicroscopia elettronica.

5. Progressi verso il CryoEM: procedure a macchia negativa per campioni biologici.

Shane Gonen.

6. Impostazione dell'illuminazione parallela su Talos Arctica per la raccolta di dati ad alta risoluzione.

Mark A. Herzik, Jr.

7. Raffinamento multicorpo di immagini crio-EM in RELION.

Takanori Nakane e Sjors H. W. Scheres.

8. Valutazione della risoluzione locale e direzionale delle mappe di densità crio-EM.

Sriram Aiyer, Cheng Zhang, Philp R. Baldwin e Dmitry Lyumkis.

9. Modellazione e convalida automatizzata di complessi proteici nelle mappe crio-EM.

Tristan Cragnolini, Aaron Sweeney e Maya Topf.

10. Cristallografia elettronica 2D di array ordinati di proteine di membrana a singolo, doppio e multiplo strato.

Matthew C. Johnson, Yusuf M. Uddin, Kasahun Neselu e Ingeborg Schmidt-Krey.

Parte III - Cristallografia elettronica di cristalli 2d.

11. Preparazione dei campioni e raccolta dei dati per studi di cristallografia elettronica sulle strutture delle proteine di membrana e sull'interazione lipidi-proteine.

Ka-Yi Chan, Chloe Du Truong, Yu-Ping Poh e Po-Lin Chiu.

12. Analisi di singole particelle per la cristallografia elettronica 2D ad alta risoluzione.

Ricardo Righetto e Henning Stahlberg.

13. Preparazione di campioni MicroED e raccolta di dati per cristalli di proteine.

Guanhong Bu e Brent L. Nannenga.

PARTE IV - DIFFRAZIONE ELETTRONICA DI MICROCRISTALLI (MICROED).

14. Rilevamento di microcristalli per CryoEM.

Simon Weiss, Sandra Vergara, Guowu Lin e Guillermo Calero.

15. Raccolta di dati a basse dosi e danni da radiazioni nella MicroED.

Johan Hattne.

16. Automazione della raccolta dati a rotazione continua per MicroED.

M. Jason de la Cruz.

17. Determinazione ab initio di strutture peptidiche mediante MicroED.

Chih-Te Zee, Ambarneil Saha, Michael R. Sawaya e Jose A. Rodriguez.