Capire la simulazione molecolare - dagli algoritmi alle applicazioni (Frenkel Daan (FOM Institute for Atomic and Molecular Physics The Netherlands))

Recensioni dei lettori

Il libro è molto apprezzato per le sue spiegazioni chiare dei metodi di simulazione molecolare, che lo rendono una scelta popolare per studenti e ricercatori. È particolarmente utile per i principianti e copre sia le tecniche Monte Carlo (MC) che quelle di dinamica molecolare (MD). Tuttavia, alcuni lettori hanno riscontrato problemi con la qualità della versione e-book, la dipendenza da pratiche di programmazione obsolete come il Fortran e l'attenzione agli algoritmi piuttosto che agli esempi pratici di codifica.

Spiegazioni chiare dei concetti di simulazione molecolare, ottimo per i principianti, algoritmi utili, copertura dettagliata dei metodi MC e MD, consigliato dai consulenti, versione cartacea di alta qualità.

La versione e-book soffre di scarsa qualità con testi e simboli mancanti, si concentra su codice Fortran obsoleto, alcuni contenuti sembrano copiati da altri testi classici, manca di tecniche MD avanzate, potrebbe non servire agli utenti avanzati.

(basato su 23 recensioni dei lettori)

Titolo originale:

Understanding Molecular Simulation - From Algorithms to Applications (Frenkel Daan (FOM Institute for Atomic and Molecular Physics The Netherlands))

Contenuto del libro:

Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to Applications" spiega la fisica alla base delle "ricette" della simulazione molecolare per la scienza dei materiali. I simulatori al computer si trovano continuamente di fronte a questioni riguardanti la scelta di una particolare tecnica per una determinata applicazione. Esiste un'ampia varietà di strumenti, quindi la scelta della tecnica richiede una buona comprensione dei principi di base. E soprattutto, tale comprensione può migliorare notevolmente l'efficienza di un programma di simulazione. L'implementazione dei metodi di simulazione è illustrata da pseudocodici e dal loro uso pratico nei casi di studio utilizzati nel testo.

Dalla prima edizione di soli cinque anni fa, il mondo della simulazione è cambiato in modo significativo: le tecniche attuali sono maturate e ne sono apparse di nuove. Questa nuova edizione affronta questi nuovi sviluppi; in particolare, sono presenti sezioni su:

- Il campionamento dei percorsi di transizione e l'attraversamento diffusivo delle barriere per simulare gli eventi.

- La dinamica dissipativa delle particelle come tecnica di simulazione a grana grossa.

- Nuovi schemi per calcolare le forze a lungo raggio.

- Dinamica hamiltoniana e non hamiltoniana nel contesto delle simulazioni di dinamica molecolare a temperatura e pressione costanti.

- Algoritmi a passi multipli come alternativa ai vincoli.

- Difetti nei solidi.

- Il campionamento di Rosenbluth arricchito di potature, il recoil-growth e le rotazioni concertate per molecole complesse.

- Tempra parallela per hamiltoniani vetrosi.

Sono inclusi esempi che evidenziano applicazioni attuali e i codici dei casi di studio sono disponibili sul World Wide Web. Dalla prima edizione sono stati aggiunti numerosi nuovi esempi per illustrare le applicazioni più recenti. Questa nuova edizione contiene anche domande. Non si presuppone alcuna conoscenza preliminare della simulazione al computer.