Biologia quantitativa: Teoria, metodi computazionali e modelli

Recensioni dei lettori

Attualmente non ci sono recensioni dei lettori. La valutazione si basa su 9 voti.

Titolo originale:

Quantitative Biology: Theory, Computational Methods, and Models

Contenuto del libro:

Un'introduzione alla modellazione quantitativa dei processi biologici, che presenta approcci alla modellazione, metodologia, algoritmi pratici, strumenti software ed esempi di ricerca attuale.

La modellazione quantitativa dei processi biologici promette di espandere la ricerca biologica da una scienza di osservazione e scoperta a una scienza di previsione rigorosa e analisi quantitativa. Il campo della biologia quantitativa, in rapida crescita, cerca di utilizzare le emergenti capacità tecnologiche e computazionali della biologia per modellare i processi biologici. Questo libro di testo offre un'introduzione alla teoria, ai metodi e agli strumenti della biologia quantitativa.

Il libro introduce innanzitutto i fondamenti della modellazione biologica, concentrandosi su alcuni dei formalismi più utilizzati. Presenta poi una metodologia essenziale per l'analisi dei dati biologici guidata da modelli, che comprende metodi come la ricostruzione di reti, la quantificazione dell'incertezza e la progettazione sperimentale; algoritmi pratici e pacchetti software per la modellazione di sistemi biologici; esempi specifici di ricerche attuali di biologia quantitativa e di metodi specializzati correlati. La maggior parte dei capitoli offre problemi, da semplici a complessi, che mettono alla prova la padronanza del lettore di tecniche chiave come le simulazioni deterministiche e stocastiche e l'analisi dei dati. Molti capitoli includono frammenti di codice che possono essere utilizzati per ricreare analisi e generare figure relative al testo. Gli esempi sono presentati nei tre linguaggi informatici più diffusi: Matlab, R e Python. Una serie di risorse online integra il testo.

I redattori sono da tempo organizzatori della Scuola estiva annuale di q-bio, fondata nel 2007. Attraverso la scuola, i redattori hanno contribuito a formare più di 400 studenti in visita a Los Alamos, NM, Santa Fe, NM, San Diego, CA, Albuquerque, NM e Fort Collins, CO. Questo libro si ispira ai programmi della scuola e la maggior parte dei collaboratori ha partecipato alla scuola come studenti, docenti o entrambi.

Collaboratori.

John H. Abel, Roberto Bertolusso, Daniela Besozzi, Michael L. Blinov, Clive G. Bowsher, Fiona A. Chandra, Paolo Cazzaniga, Bryan C. Daniels, Bernie J. Daigle, Jr, Maciej Dobrzynski, Jonathan P. Doye, Brian Drawert, Sean Fancer, Gareth W. Fearnley, Dirk Fey, Zachary Fox, Ramón Grima, Andreas Hellander, Stefan Hellander, David Hofmann, Damian Hernandez, William S. Hlavacek, Jianjun Huang, Tomasz Jetka, Dongya Jia, Mohit Kumar Jolly, Boris N. Kholodenko, Markek Kimmel, Michal Komorowski, Ganhui Lan, Heeseob Lee, Herbert Levine, Leslie M Loew, Jason G. Lomnitz, Ard A. Louis, Grant Lythe, Carmen Molina-Par s, Ion I. Moraru, Andrew Mugler, Brian Munsky, Joe Natale, Ilya Nemenman, Karol Nienaltowski, Marco S. Nobile, Maria Nowicka, Sarah Olson, Alan S. Perelson, Linda R. Petzold, Sreenivasan Ponnambalam, Arya Pourzanjani, Ruy M. Ribeiro, William Raymond, Herbert M. Sauro, Michael A. Savageau, Abhyudai Singh, James C. Savageau, Abhyudai Singh. Schaff, Boris M. Slepchenko, Thomas R. Sokolowski, Petr Sulc, Andrea Tangherloni, Pieter Rein ten Wolde, Philipp Thomas, Karen Tkach Tuzman, Lev S. Tsimring, Dan Vasilescu, Margaritis Voliotis, Lisa Weber.