Analisi dei dati Rna-Seq: Un approccio pratico

Recensioni dei lettori

Questo libro è molto apprezzato per la sua dettagliata introduzione alla tecnologia RNAseq, che lo rende ideale per i principianti e per gli insegnanti di bioinformatica. Copre in modo esauriente le applicazioni pratiche, include istruzioni a riga di comando e fornisce esempi reali per facilitare l'apprendimento. Tuttavia, alcuni utenti hanno riscontrato problemi nella disponibilità dei dati dai siti web consigliati e hanno ritenuto che alcuni aspetti tecnici, in particolare quelli relativi a R, fossero poco rappresentati.

⬤ Molto pratico e completo
⬤ eccellente per i principianti
⬤ include istruzioni passo-passo ed esempi reali
⬤ buono per l'insegnamento
⬤ autonomo e copre vari strumenti e metodi RNAseq.

⬤ Non è stato possibile accedere ad alcuni set di dati
⬤ potrebbe non coprire tutti gli strumenti rilevanti
⬤ sezione sottorappresentata su R
⬤ più orientata ai bioinformatici che agli scienziati di laboratorio.

(basato su 15 recensioni dei lettori)

Titolo originale:

Rna-Seq Data Analysis: A Practical Approach

Contenuto del libro:

Lo stato dell'arte nell'analisi del trascrittoma I dati di sequenziamento dell'RNA (RNA-seq) offrono informazioni senza precedenti sul trascrittoma, ma lo sfruttamento di queste informazioni con strumenti bioinformatici è tipicamente un collo di bottiglia. L'analisi dei dati RNA-seq: un approccio pratico consente ai ricercatori di esaminare l'espressione differenziale a livello di geni, esoni e trascritti e di scoprire nuovi geni, trascritti e interi trascrittomi.

Ogni capitolo inizia con un inquadramento teorico, seguito dalla descrizione degli strumenti di analisi e da esempi pratici. Accessibili sia ai bioinformatici che agli scienziati di laboratorio non programmatori, gli esempi illustrano l'uso di strumenti a riga di comando, R e altri strumenti open source, come il software grafico Chipster.

Questa guida, che accompagna i lettori attraverso l'intero flusso di lavoro dell'analisi dei dati, fornisce una panoramica dettagliata dei principali metodi di analisi dei dati RNA-seq e spiega come utilizzarli nella pratica. È adatta a ricercatori con un'ampia varietà di background, tra cui biologia, medicina, genetica e informatica. Il libro può essere utilizzato anche in un corso di laurea o di perfezionamento.