Algoritmi in Bioinformatica: Teoria e implementazione

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Il libro offre un'esplorazione innovativa ed esaustiva della bioinformatica, scritta da un'autorità del settore. Semplifica efficacemente concetti complessi e mostra chiare relazioni tra gli argomenti, rendendolo adatto a studenti universitari e laureati di livello avanzato.

L'autore spiega chiaramente concetti difficili, presenta materiale complesso in modo facile da capire, dimostra una conoscenza completa della filogenetica e della genomica, include molti esempi di codice e mantiene una chiara separazione tra opinioni e fatti.

Il libro può essere più utile per i lettori che sono già almeno principianti avanzati in informatica.

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Titolo originale:

Algorithms in Bioinformatics: Theory and Implementation

Contenuto del libro:

Algoritmi in Bioinformatica: Theory and Implementation è un testo conciso ma completo di bioinformatica che descrive alcuni dei principali algoritmi utilizzati per chiarire le funzioni e le relazioni biologiche. Questa guida unica agli algoritmi in bioinformatica affronta l'argomento lungo le quattro linee convergenti di matematica, implementazione, simulazione e sperimentazione, e può essere ideale per i corsi di bioinformatica di livello universitario, per i ricercatori, per i dottorandi e per i sociologi o gli ingegneri incaricati dell'analisi dei dati.

Quest'opera inizia con un'introduzione generale alla biologia, che ha lo scopo di portare una comprensione più concreta dei processi molecolari che riguardano il campo della Bioinformatica. Dopo questa introduzione, vengono approfonditi argomenti come l'allineamento di sequenze, l'allineamento forzato, il rilevamento di motivi, i loghi di sequenza, le catene di markov o l'entropia dell'informazione. Vengono inoltre descritti altri approcci innovativi, come l'allineamento di auto-sequenze, le macchie digitali oggettive (ODS) o la previsione spettrale e l'algoritmo del rivelatore di probabilità discreta (DPD).

Quest'opera contiene anche spiegazioni approfondite, passo dopo passo, sul significato dei modelli di sfondo in bioinformatica da diversi punti di vista. Soprattutto, introduce i lettori all'arte degli algoritmi, mostra come progettare le implementazioni al computer e fornisce ampi esempi di lavoro con casi di studio dettagliati.

Le implementazioni qui presentate evidenziano come la programmazione nativa in javascript possa ampliare gli orizzonti delle possibilità della bioinformatica, tenendo conto delle potenzialità dei moderni browser Internet. Le illustrazioni grafiche sono utilizzate per i dettagli tecnici sugli algoritmi computazionali, per favorire una comprensione approfondita del loro funzionamento interno.

Inoltre, quest'opera porta all'attenzione del lettore più di 100 implementazioni open source e 33 presentazioni powerpoint.